二氧化锰在有机化学之中十分有用。被用于氧化物的二氧化锰的形态不一，因为二氧化锰有多个结晶形态，化学式可以写成MnO -x(H O)n，其中x介乎0至0.5之间，而n可以大于0。二氧化锰可在不同pH下的    (KMnO )和  锰(MnSO )的反应之中产生。啡色的二氧化锰沉淀物很干和很活跃。 有效的有机溶包括芳香性物质、    、醚、    和酯类等。
 其中一个二氧化锰专用的化学反应是将醇类转化为醛类。即使该醇类中有双键，也不会被二氧化锰所氧化：cis-RCH=CHCH2OH + MnO2 → cis-RCH=CHCHO + H2O + MnO
 当中的产物即使有多活跃也不会再被氧化。二醇类可被二氧化锰氧化为二醛。其他二氧化锰的反应极之多，可用在氧化出胺、芳香物和三醇等。
 实验室用途
 用做过氧化 (双氧水)分解制氧气时的催化剂。